《方案》提出，要轉變農業發展方式，加快農業綠色發展，走產出高效、產品安全、資源節約、環境友好的現代農業發展道路，走鄉村綠色發展之路，率先建成綠色生態農業強省。到2020年，農業資源保障能力進一步增強，全省耕地保有量不少于3719萬畝，劃定永久基本農田3164萬畝，耕地質量提升0.5個等級；農業面源污染得到有效防治，農藥和化肥使用量實現負增長、利用率均達到40%，農膜回收率達到80%，秸稈綜合利用率達到85%，畜禽糞污綜合利用率達到75%以上；農業生態環境明顯改善，全省退耕還林30萬畝，森林覆蓋率達到60.5%以上，森林蓄積量達到6.43億立方米，鄉村綠化覆蓋率達到30%以上，濕地面積不低于2630萬畝；綠色優質農產品供應能力進一步增強，糧食綜合生產能力穩定在1200萬噸以上。

《方案》要求，落實嶺南特色現代農業功能區制度，建立嶺南特色農業布局制度，建立相對貧困村農業綠色開發機制，著力構建嶺南特色現代農業發展新格局。到2019年年底前劃定糧食（水稻）生產功能區1350萬畝、重要農產品（天然橡膠）生產保護區60萬畝；到2020年建設現代農業產業園150個和“一村一品、一鎮一業”農業特色專業鎮200個。

《方案》要求，建立健全耕地保護和輪作休耕制度、完善農業節水機制、健全嶺南農業生物資源保護與利用體系，加強農業資源保護與節約利用。到2020年，建設高標準農田2556萬畝，基本完成中型及小型灌區取水許可證發放工作，全面實施農業取水許可管理。

《方案》提出，要建立健全產地環境保護與治理制度，劃定農用地土壤環境質量類別，實施農用地分類管理，建立工業和城鎮污染向農業轉移防控機制。建立農業綠色循環低碳生產制度，實施農業產業準入負面清單，根據土地承載能力，依法關閉或搬遷禁養區內畜禽養殖場（小區）和養殖專業戶，適度調減珠三角等水網地區養殖總量，引導畜牧業生產向環境容量大的農區和山區轉移。健全農業投入品減量使用制度，深入推進化肥農藥使用量零增長行動，推廣測土配方施肥、有機肥替代化肥。建立農業廢棄物資源化利用制度，推進畜禽養殖廢棄物資源化利用設施標準化建設和升級改造，落實畜禽規模養殖環境評價準入制度，完善畜禽養殖污染監管制度。到2020年，全省生豬出欄量穩定在3300萬頭以上，生豬自給率穩定在60%左右，生豬養殖規模化率達到65%以上；測土配方施肥技術覆蓋率達到90%以上；規模養殖場糞污處理設施裝備配套率達到95%以上，大型規模養殖場糞污處理設施裝備配套率提前一年達到100%。

《方案》提出，要建立農業綠色生態系統，構建嶺南田園生態系統、加強水生生態保護修復、推進濕地公園和熱帶雨林建設。到2020年，全省綠化美化村莊1.6萬個，建成全國休閑農業和鄉村旅游示范縣10個、中國美麗休閑鄉村20個、廣東農業公園50個、省級休閑農業和鄉村旅游示范鎮（點）400個，建立國家級海洋牧場示范區14個，建成濕地公園280個以上。

《方案》強調，要構建支撐農業綠色發展的科技創新體系，完善農業生態補貼制度，建立綠色農業標準體系，完善綠色農業法規體系，建立農業資源環境生態監測預警體系，推行市場化機制，健全農業人才培養機制，不斷強化農業綠色發展的創新驅動與約束激勵。加大涉農財政轉移支付資金對農產品主產區的支持力度，建立生態公益林分區域差異化補償制度，到2020年，省級以上生態公益林效益補償標準提高到平均每畝40元。